Il Consiglio Direttivo dell'AIT ha funzioni consultive, di controllo e di raccordo tra assemblea e direttore generale. Svolge inoltre funzioni di amministrazione attiva: in particolare, sulla base delle proposte presentate dalle conferenze territoriali e nel rispetto degli indirizzi dell'assemblea, definisce la proposta tariffaria, i conseguenti aggiornamenti alla convenzione e relativo disciplinare ed approva il regolamento d'utenza e la carta della qualità del servizio, e relative modifiche, che il gestore è tenuto ad adottare.